Calentar el aceite en una cacerola grande a fuego medio. Agregar las partes blancas y verdes claras de las cebollas verdes, el pimiento y el ajo; cocinar, revolviendo ocasionalmente, durante 4 a 5 minutos o hasta que estén suaves. Agregar el comino y tomillo; cocinar, revolviendo ocasionalmente, durante 1 minuto. Agregar los frijoles, la calabaza, los tomates y su jugo, el caldo y agua; llevar a hervir. Reducir el fuego a bajo; cocinar por 10 minutos. Agregar la sal y pimienta de cayena. Decorar cada porción con las rodajas de cebolla verde oscuro.